A son retour d'Afghanistan, Thomas Magnum, officier décoré de l'unité d'élite des SEAL de la Marine américaine, s'installe à Hawaï. Tout en assurant la sécurité du domaine du richissime Robin Master, Magnum, hébergé sur la propriété dans la maison des invités, officie en tant que détective privé.
Suite à un important séisme, une plaque tectonique provoque un véritable soulèvement des océans. Pour faire face à la panique, l'armée américaine décide de construire une arche pour préserver la vie sur Terre.