Après avoir débuté comme reporter photographe, Jacques Otmezguine tourne publicités, films d'entreprise et documentaires. Au début des années 80, l'écrivain Michel Lebrun le convainc d'écrire un polar Prunelle Blues, publié aux Editions du Fleuve Noir en 1983, devient trois ans plus tard son premier long métrage, avec Michel Boujenah et Vincent Lindon.
Jacques Otmezquine se consacre ensuite à la réalisation de téléfilms, signant notamment Le secret d'Elissa Rhaïs avec Emmanuel Salinger (1993) et Julien l'apprenti, dans lequel on remarque le tout jeune Gaspard Ulliel en 2000. Pour le grand écran, il s'essaie à différents genres : le mélodrame familial avec Bruits d'amour en 1997, le thriller psychologique avec Une employée modèle en 2003, et le film choral avec Trois couples en quête d'orage (2005), chronique sentimentale qui réunit Hippolyte Girardot, Claire Nebout et Samuel Labarthe.