En l'an 2026, deux ans après avoir été libérés de S.A.O, Kazuto et ses amis survivants profitent enfin de jours paisibles. Récemment, la réalité augmentée est devenue possible grâce à l'Augma, et avec cette mode vient son lot de modifications du quotidien.
C'est l'été. Mary vient d’emménager chez sa grand-tante dans le village de Manoir Rouge. Dans la forêt voisine, elle découvre une fleur mystérieuse qui ne fleurit qu'une fois tous les 7 ans. On l'appelle la "fleur de la sorcière".
Dragon Cry est un artefact magique qui contient la colère des dragons confinés dans un sceptre. Il possède suffisamment de pouvoir pour détruire le monde et a été dérobé par Zash, un traître du royaume avant d'être délivré au roi du Royaume de Stella. Une quête a été formulée afin de récupérer le Dragon Cry, que Natsu, Lucy, ...