Chihiro, une fillette de 10 ans, est en route vers sa nouvelle demeure en compagnie de ses parents. Au cours du voyage, la famille fait une halte dans un parc à thème qui leur paraît délabré. Lors de la visite, les parents s’arrêtent dans un des bâtiments pour déguster quelques mets très appétissants, apparus comme par enchantement. Hélas cette nourriture les transforme en porcs. Prise de panique, Chihiro s’enfuit et se retrouve seule dans cet univers fantasmagorique ; elle rencontre alors l’énigmatique Haku, son seul allié dans cette terrible épreuve...
Le gratte-ciel Ziggurat abrite les élites de Metropolis. Le détective Shunsaku Ban enquête sur un trafic d'organes humains et rencontre le docteur Laughton. Celui-ci a créé Tima, une merveilleuse androïde destinée à trôner au sommet de Ziggurat.