La CIA lance le programme Blackbriar, visant à fabriquer une nouvelle génération de tueurs supérieurement entraînés. Jason est, pour le directeur des opérations spéciales, une menace et une tache à effacer. Ordre est donné de le supprimer...
A Londres, le policier Nicholas Angel est le meilleur de son équipe. Le chef de la brigade décide donc de le "promouvoir" dans le petit village de Sandford, où une série de crimes étranges va le mettre dans l'action...
Traumatisé par le Second Impact, le Quatrième Ange attaque Tokyo III et le destin de l'humanité est désormais entre les mains de l'agence spéciale Nerv. Le jeune Shinji Ikari est contraint de piloter EVA-01. Ce dernier, accompagné du pilote Rei Ayanami, aux commandes de l'EVA-00, sont chargés de se battre, mais EVA-01 est endommagé par le Sixième Ange. Misato Katsuragi met au point un plan pour transférer toute l'électricité du Japon dans le canon positron d'EVA-01 afin de vaincre l'Ange.
John McClane se trouve confronté à un nouveau genre de terrorisme. Le réseau informatique national est détruit de façon systématique, plongeant le pays dans le chaos. Le cerveau de cette opération a tout calculé à la perfection. Ou presque...