Padre Pio, l'un des plus grands saints de l'histoire, canonisé par saint Jean-Paul II, a été mis sur écoute dans le confessionnal et accusé d'avoir des relations sexuelles avec ses filles spirituelles. Il a subi une persécution acharnée de la part de certains hommes d'Église. Le documentaire propose, à la manière d'un thriller, des témoignages et des documents jamais divulgués sur le complot mené contre ce grand mystique qui a porté les stigmates du Christ pendant 50 années consécutives.