Michel Gondry avait déjà dirigé Emma de Caunes pour le clip de Knives Out, extrait de l'album Amnesiac du groupe britannique de rock Radiohead.
Dans l'édition DVD du film, Michel Gondry propose une version inédite de La Science des rêves. Incluant scènes alternatives et coupées, La Science des rêves - Le film B (encore appelé La Science des rêves - Version B) donne une nouvelle dimension, ainsi qu'une nouvelle durée (1h10 au lieu de 1h45), au film d'origine. Cette version bénéficia également d'une exploitation, sporadique, en salles.