Le scénario de Girl a été développé dans le cadre de la Cinéfondation de Cannes en 2016. Deux ans plus tard, le film est sélectionné à Un Certain Regard d'où il repart avec le Prix d'interprétation pour Victor Polster et la Caméra d'Or, qui récompense le meilleur premier film.
Alors qu'il commençait à étudier le cinéma dans une école, Lukas Dhont est tombé sur un article relatant le parcours d'une jeune fille née dans un corps de garçon mais convaincue d'être une fille : "J’ai tout de suite ressenti de l’admiration, et j’ai été enthousiasmé à l’idée de pouvoir écrire sur un personnage comme elle : quelqu’un de courageux, qui très jeune remettait en cause le lien qu’établit la société entre sexe et genre".
Avec Girl, Lukas Dhont souhaitait aborder notre perception du genre, une question à laquelle il a été confronté dès l'enfance : "Quand j’étais petit mon père voulait que je sois boy-scout. Il nous emmenait, mon frère et moi, tous les 15 jours jouer avec d’autres enfants dans la boue ou faire du camping. Tous les deux on détestait ça. On préférait de loin le théâtre, la danse et le chant, où nous pouvions nous exprimer. Vous pouvez imaginer la confusion quand on a appris que c’était vu comme des activités, « pour les filles ». J’étais un garçon, comment pouvais-je aimer ça ? J’ai donc fini par arrêter tout ça parce que je ne voulais pas qu’on se moque de moi".
Il cherchait également à peindre "la lutte intérieure d’une jeune héroïne, capable de mettre son corps en danger pour pouvoir devenir la personne qu’elle veut être. Une fille qui doit faire le choix d’être elle-même à seulement 15 ans, quand pour certains ça prend toute la vie".
Issu d'une formation de danseur, Victor Polster fait ses premiers pas devant une caméra avec Girl. Environ 500 personnes entre 14 et 17 ans ont auditionné, aussi bien des filles et des garçons cisgenres que des personnes transgenres. Faute de trouver un(e) interprète convaincant(e), l'équipe s'est tournée vers le casting des danseurs et y a découvert Polster, qui correspondait à ce qu'elle recherchait.