Le scénario de Piranha 3DD a été commandé au même duo qui avait donné origine au sanglant Saw 3D : Patrick Melton et Marcus Dunstan.
Les fans de Piranha 3D, étonnés de retrouver dans la continuation Piranha 3DD le personnage central du Shérif Fallon, interprété par Ving Rhames, ont créé sur Internet une petite polémique. Comment peut-il réapparaitre s'il finit l'histoire précédente dans son bateau, attaqué par les sanglants prédateurs ? Mais le synopsis entretient le suspens, puisque sa mort n'a jamais vraiment été montrée, et peut-être que son apparition se fait sous forme de flashback, ou alors en fauteuil roulant... Allez, un peu d'imagination !
John Gulager raconte que les nombreuses scènes sous l'eau représentaient un grand défi pour la production. Une partie de l'équipe, dont son cameraman, était constituée de vrais plongeurs, et il fallait s'équiper d'appareils de communication aquatiques. En plus, les scènes étaient toujours surveillées par des maîtres nageurs au cas où un acteur n'arriverait pas à retenir son souffle assez longtemps...