Tandis que de nouveaux barons de la drogue se disputent le pouvoir, des journalistes mènent l’enquête et les autorités flirtent dangereusement avec la corruption.
L'infiltration de Walt prend un tour inattendu. Amado sort de prison après trois mois d'incarcération. À Juárez, l'inspecteur de police Victor cherche une fille disparue.
S03E02 - Como la Flor
Andréa, une journaliste de Tijuana, s'intéresse aux ados invités au mariage d'Enedina Arellano avec un célèbre avocat. Walt réfléchit à déménager.
S03E03 - La nouvelle génération
Le cartel de Sinaloa réagit à la suite d'une conversation décevante avec les Arellanos concernant l'achat de terres. Andréa continue son enquête sur les Narcojuniors.
S03E04 - Aéroport international Don Miguel Hidalgo y Costilla
Les cartels de Tijuana et Sinaloa sont en guerre et tous se demandent où se positionne Juárez, mais Amado a d'autres plans à Cuba. Ramón cherche à se venger de Chapo.
S03E05 - Sur le terrain
Walt rejoint une équipe mexicaine dirigée par le général Rebollo et destinée à retrouver les responsables du massacre de Guadalajara et de la mort du cardinal Posada.
S03E06 - La patronne
Choqué par un meurtre, Victor passe à l'action. La violence s'accentue à Tijuana. Désormais à la tête du cartel, Enedina élabore un plan pour défier ses rivaux.
S03E07 - La Voz
Des journalistes sont visés après un reportage sur les assassins de Colosio. Mayo et Chapo concluent une alliance contre le cartel de Tijuana. Victor pose des questions.
S03E08 - Dernière danse
Devant l'échec de la torture, Walt change de tactique avec Alex. Andrea passe au crible les dossiers financiers relatifs à Hank et au PRI. Amado prépare son avenir.
S03E09 - Le grand bilan
Andrea établit un rapprochement stupéfiant qui entraîne une avalanche de réactions. Avec l'aide d'Alex, Walt resserre l'étau sur Benjamín. Hank menace Amado.
S03E10 - Vivre en temps de guerre
Les autorités mexicaines et américaines se lancent aux trousses d'Amado. En prison, Chapo fait le nécessaire pour prouver qu'il est le patron. Enedina missionne Ramón.