Dieu existe-t-il ? La question est sur toutes les lèvres dans une petite ville du sud-est de la France depuis qu'une jeune fille de 18 ans affirme avoir vu la Vierge Marie. S'agit-il d'une hallucination, d'un mensonge ou de la vérité ? La nouvelle se répand comme une traînée de poudre et bientôt des milliers de pèlerins envahissent le paisible village afin de se recueillir sur le lieu des apparitions présumées. Pour démêler le vrai du faux, le Vatican réunit une commission d'enquête chargée de faire la lumière sur ces événements. Au sein de ce groupe : Jacques, grand reporter pour un quotidien français totalement étranger à ce monde, voit ses convictions être bouleversées.
Trois ans après Marguerite, Xavier Giannoli revient avec L'Apparition, un drame qui, à en croire les premières images révélées, prend des allures d'enquête policière au fur et à mesure que le personnage de Jacques cherche à élucider cette affaire. Dans le rôle de ce dernier, on retrouve Vincent Lindon qui tourne pour la première fois sous la direction du réalisateur d'À l'origine. Face à lui, Galatea Bellugi, révélée par Keeper et Réparer les vivants, incarne Anna, la jeune fille au centre de toutes les attentions et dont les visions sont vite exploitées à des fins commerciales. Enfin, Patrick d'Assumçao joue un prêtre dont la foi semble inébranlable. Le comédien a déjà eu l'occasion d'incarner un homme d'Église dans Trois souvenirs de ma jeunesse et la série d'Arte Ainsi soient-ils.